上游引物（forward primer）和下游引物（reverse primer）是PCR技术中的核心组成部分，是控制PCR特异性的关键。上游引物是指对模板序列的5'端进行放大的引物，下游引物是指对模板序列的3'端进行放大的引物。
在PCR实验中，上游引物主要用于引发PCR反应，在PCR实验中一般设计多对引物，这样就可以引发多个PCR反应。在一次PCR反应中，上游引物浓度需要高于下游引物才能使反应更有效率，但是如果过于浓缩，会引发非特异性扩增。
上游引物的设计需要在模板序列上判别可能存在的低温缺失和二硫键的影响，特别是在设计过程中需要注意引物和模板序列能形成稳定的酸性二硫键。在PCR实验中，引物的特异性决定了反应的特异性。因此，要尽可能选择能够确保序列特异性的引物对，从而使PCR反应更加精确。
